対応までの間、独自アプリ登録のパスワード認証を利用しようと考えましたが、

上手く動作しませんでした。

SAML認証に時間がかかるようであれば、先にパスワード認証にご対応いただき、追ってSAML認証にご対応いただけると幸いです。

リクエストの登録ありがとうございます。
SAML認証は開発を伴うため対応にお時間をいただいております。

申し訳ございませんが、しばらくお待ちくださいますようお願いいたします。
進捗がございましたら、こちらへのコメントでご報告いたします。

JIRA Cloudのパスワード認証につきましては、アプリ名「JIRA （クラウド型）」で
登録がございますので、こちらをご利用いただければと存じます。

どうぞよろしくお願いいたします。

JIRAクラウドのパスワード認証ですが、URLが固定になっているので、ログインするとID管理画面に飛ばされてしまいます。

手動で操作する場合、

https://[ProjectName].atlassian.net　にアクセスすると、ログイン画面にリダイレクトされるので、

そこでユーザ名、パスワードを入力しています。

この動きを再現できないでしょうか？

「管理ページ」－「アプリメニュー」－「JIRA （クラウド型）」を選択－「編集」ボタン の操作で
「ログインURL」を編集いただけます。

こちらに「https://[ProjectName].atlassian.net」を設定することで希望の動作となるか
ご確認いただけますでしょうか。リダイレクト先のログインフォームが同一であれば自動ログインに成功いたします。

どうぞよろしくお願いいたします。

想定している動作を再現することができました。

ご対応ありがとうございました。

確認いただきましてありがとうございます。

SAML認証に対応するまでは、こちらをご利用くださいますようお願いいたします。